В 1777году Екатериной Второй был подписан указ о строительстве оборонительной линии Азов-Моздок. Построенный в 1788 году Невинномысский редут стал одной из десяти крепостей для защиты русских земель от набегов горцев. Возле редута возникла казачья станица. Первыми жителями стали 200 семей казаков хоперского полка.
В 1872 году началось строительство железнодорожной линии Ростов- Владикавказ. Трасса прошла в двух километрах от станицы. Стройка привлекла сюда множество рабочих, многие из которых здесь и остались.
Окрестные районы были обильны зерном и шерстью. Первыми предприятиями в Невинномысске и стали паровая мельница, кожевенный завод и шерстомойная фабрика. К концу девятнадцатого века станица являлась крупнейшим торговым центром с торговым оборотом в несколько миллионов рублей.
Население станицы делилось на две части. Казакам принадлежали все земельные наделы и административная власть. Иногородние преимущественно работали по найму. С началом первой мировой войны большинство мужского населения было призвано в армию. Революцию 17-го года жители Невинномысской восприняло враждебно. Казаческое население жило зажиточно и имело определенные льготы. Политика большевиков, проводивших конфискацию земель и обложивших контрибуцией богачей, сделала многих казаков сторонниками белогвардейцев.
Неоднократно станицу захватывали то белые, то красные. Против конницы Шкуро воевала красная бригада под командой Кочубея. Оба в 1916 году служили на Турецком фронте в одной сотне. Советская власть в Невинномысской окончательно была установлена в 1920 году.
11 октября 1939 года станица получила статус города. Во время Отечественной войны за пять месяцев оккупации Невинномысск был практически полностью разрушен. Восстановление города началось практически сразу после освобождения. В 1952 году было принято решение о строительстве завода азотных удобрений. Ныне « Невинномысский Азот» крупнейшее предприятие города.
Любимые места отдыха горожан – вводно-развлекательный комплекс, парк семейного отдыха, роллердром.